在孤兒院長(zhǎng)大的痞子華一龍?jiān)谝淮味窔杏已壑貍?，接受了眼角膜移植手術(shù)后意外獲得了透視眼的特異功能，借此順利考入全國(guó)頂尖的北方醫(yī)科大學(xué)“臨床醫(yī)學(xué)特殊培訓(xùn)班”（精英天才班），與宿舍四兄弟在醫(yī)學(xué)院一同成長(zhǎng)的騷鬧熱血故事。在醫(yī)大生活中，各種重口味醫(yī)學(xué)課程、學(xué)霸與學(xué)渣互相比拼、魔鬼教授與調(diào)皮學(xué)生斗智斗勇，讓華一龍不斷的成長(zhǎng)。

死后五百年，還被人們銘記的人，他們的靈魂便可以成為“靈體”。 根據(jù)現(xiàn)代人的印象，呈現(xiàn)出與生前的人形不同的形態(tài)。如今，不少歷史上的著名人物成為“靈體”，在新的時(shí)代，述寫新的傳奇。作品獨(dú)創(chuàng)性的提出“魂”與“靈體”之間關(guān)系的概念——一直被人們記住的歷史人物的“魂”最后幻化成了“靈體”寄宿在了后來的一代又一代的人身上，并永不停息的持續(xù)著“他們”之間的戰(zhàn)爭(zhēng)，此所謂“魂戰(zhàn)紀(jì)”。

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥?kù)`親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥?kù)`訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。