原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂(lè)觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥?kù)`親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥?kù)`訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個(gè)診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類(lèi)與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

2333年，地球被寒，藻，葳，雛，炎，氣，六星攻占，長(zhǎng)得好看的人成為寵物，長(zhǎng)得丑的被丟到荒野沙漠自生自滅。六星人養(yǎng)膩了現(xiàn)代人想養(yǎng)古人，于是發(fā)明了名將機(jī)，啟動(dòng)后能穿越時(shí)空抓古人。誰(shuí)知，天真的葳星少女伊塔一發(fā)入魂，抓到了秦始皇嬴政，給六星帶來(lái)了毀滅性打擊。寄（外星）人籬下的秦始皇與同人文寫(xiě)手徐君房和總想暗殺自己的張良以及其他被抓來(lái)的千古名將們放下前朝舊恨共同抵御天外之?dāng)常?