葉小天世襲罔替，卻非王侯；他出身世家，卻非高門。作為六扇門中的一個牢頭兒，他本想老老實實把祖上傳下來的這只鐵飯碗一代代傳承下去，卻不想被一個神棍忽悠出了那一方小天地，這一去，便是一個太歲橫空出世。

不知你有沒有聽過這么一種說法：預(yù)知前生事，今生所受事。前世之因，后世之果，如果你種下了這個因，那么無論經(jīng)過多少個輪回，你都擺脫不了這個結(jié)果。該如何化解呢？這也許是無可奈何、難以化解的宿命。 而有這么一種生意，偏偏就是要回到你種下因的這一世，找出宿命的根源，改變它，從而也改變你今生的結(jié)果。這門生意不收錢，收的僅僅是——你的一滴眼淚。 身世離奇的少女葉隱，從小被師父司音收養(yǎng)的她，在出師后，開始了這奇妙的時空之旅……

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。