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明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

我自虛空而來，舉手諸天崩碎，覆手黃泉寂滅；我為魔、為神、為仙、為人。我是蕭晨，也是萬物，亦為主宰！

佛族的三藏法師因為與女兒國國王約會而受到佛族與神族的誅殺，他的弟子齊天、天蓬、悟凈為了保護師父，不惜與諸神開戰(zhàn)！在混戰(zhàn)中因齊天與二郎神斗法發(fā)生大爆炸打碎了太虛幻境的中樞“通靈寶玉”引發(fā)太虛幻境的崩塌。唐僧的三名徒弟醒來后發(fā)現(xiàn)自己居然被炸到了21世紀的現(xiàn)代社會，三人失去神力。為了生存他們只好一邊打工賺錢一邊尋找回去的方法……