明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來(lái)，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。

為房租和水電費(fèi)發(fā)愁的大學(xué)老師王某，碰到了奉旨下凡普渡人間、化名“管音”的觀音，陰差陽(yáng)錯(cuò)之下幫助觀音化解心魔。王某為何能弱化心魔，成了觀音的心結(jié)，能弱化心魔的王某，卻不知何時(shí)心中悄悄滋養(yǎng)起心魔……面對(duì)人間界的煉獄景象，神仙是否能幫助人類(lèi)，而人類(lèi)的“心魔”又因何而來(lái)，王某等人的命途又將被牽引何處？

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂(lè)觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥?kù)`親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥?kù)`訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

生于震那帝國(guó)的宋江，是一名正義感和好奇心強(qiáng)烈的采風(fēng)，在一次際遇中被卷入禁軍的紛爭(zhēng)中，得到“天印”的能力，化險(xiǎn)為夷。帝國(guó)能源“星石”日漸枯竭，化解這一問(wèn)題的線索，就藏在震那初代帝王所造的九顆天印中。 帝國(guó)太尉高俅聲稱(chēng)履行帝王的旨意，開(kāi)始了對(duì)天印的強(qiáng)行回收計(jì)劃。面對(duì)帝國(guó)禁軍的異動(dòng)，反抗帝國(guó)的勢(shì)力紛紛崛起。江決心要平息這場(chǎng)紛亂，一路上聯(lián)絡(luò)志同道合的英豪，率領(lǐng)著以劉武山為據(jù)點(diǎn)的反抗軍，開(kāi)始了討伐高俅。