明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

主角駱島，一直以來滿足于像一個海洋中的孤島一樣生活。僅有的愛好是收集地圖和看地圖，人際交往減少到了最低限度。多年未聯(lián)系的好友丁亭的失蹤使他平靜的生活被打破了……

洛傾衣因為父親冤死，洛家滿門抄斬，恨透當朝皇上秦清軒，為了報仇，處心積慮進入皇宮，本是為了刺殺，不想被秦清軒感動，愛上秦清軒，可是被奸人挑撥差點害死了心愛的人，才知殺害自己的根本不是秦清軒后悔無比，索性最后二人都大徹大悟，經歷重重磨難終于達成了白頭偕老的美滿結局。

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……