D.B星河紀(jì)元3000年左右 人類進(jìn)入第二次大開發(fā)時代， 人造小行星成為主要的生活區(qū)域 在星河團(tuán)中形成了龐大的交通網(wǎng)絡(luò)和居住星團(tuán)群， 人造小行星的創(chuàng)制業(yè)務(wù)成為這個時代可獲得最大贏利的項(xiàng)目之一 ，能源的緊缺進(jìn)一步出現(xiàn) 而土地資源隨著人造小行星的出現(xiàn)開始貶值 大開發(fā)時代的到來， 使得沉悶逐漸沒落的世界變得動蕩而充滿希望“ 空賊團(tuán) "”宇宙牛仔“” 空間獵人“” 雇傭軍團(tuán)“” 銀河特快“ ”星球會計(jì)“ ”土地鑄造師“……各種新生行業(yè)紛紛出現(xiàn)。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

主角駱島，一直以來滿足于像一個海洋中的孤島一樣生活。僅有的愛好是收集地圖和看地圖，人際交往減少到了最低限度。多年未聯(lián)系的好友丁亭的失蹤使他平靜的生活被打破了……

在人類快速的發(fā)展下，人類和妖怪之間的平衡被打破。隨著環(huán)境的破壞，妖怪也不得不背井離鄉(xiāng)生活在人類城市。然而妖怪卻沒有屬于自己的法律保障和社會權(quán)力，這是一個人類為妖怪構(gòu)建的反烏托邦！那么妖怪們究竟要如何擺脫這悲慘的命運(yùn)呢？