故事講述了個性開朗喜歡搗亂的小學生布丁，和性格有點暴躁的黃連，倆人的日常校園生活故事。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經(jīng)的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結(jié)下深厚羈絆。

公元前265年，司馬昭病逝，其子司馬炎繼位。取代曹奐，把國號改為晉，是為晉武帝。晉武帝率領軍隊滅東吳，東吳最后一位君王孫皓被迫投降。至此三國鼎立局面徹底結(jié)束，西晉，這個長達短暫統(tǒng)治51年，混論紛爭的年代，就這樣，拉開了序幕